A Mesa da Assembleia Geral é o órgão deliberativo da AEUPA, reúne-se ordinariamente duas vezes por ano e extraordinariamente sempre que necessária.
A Assembleia é convocada pelo presidente da mesa da assembleia, para apreciar o programa, os relatórios de actividades e contas, processos Disciplinares e balancear o ano presente perspetivar o ano subsequente.
A Mesa da Assembleia Geral é composta por um Presidente da Mesa, um Vice Presidente e um Secretário que o coadjuvam e dois membros efectivos.